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溶菌酶在食品添加剂中常用于面包、糕点、饼干、饮料、啤酒等食品加工过程中，用来促进面团发酵、改善面筋质量、增加食品口感和延长保质期。其用量一般为每公斤食品添加剂0.2-0.5g。在工业中，溶菌酶可用于纺织、造纸、皮革、橡胶等行业，主要用于清除工业废水中的细菌和有机物质，提高处理效果。其用量一般为每立方米工业废水添加100-200mg。 在农业中，溶菌酶可用于提高农作物的抗病能力和生长速度，减少农药使用量。其用法一般为在种子表面喷洒，用量为每升水中添加溶菌酶10-20mg。在饲料行业中，溶菌酶可用于提高家禽、畜禽等动物的消化吸收能力，促进生长发育。其用量一般为每吨饲料添加剂2-5g。